Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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