Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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