Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan1Q99J59 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms