Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Rnf144aQ925F3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Rnf144aQ925F3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Rnf144aQ925F3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Rnf144aQ925F3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Rnf144aQ925F3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Rnf144aQ925F3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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