Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms