Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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