Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snx18Q91ZR2 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms