Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tdrd3Q91W18 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms