Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDJ3

Hdlbp, Vigilin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HdlbpQ8VDJ3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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HdlbpQ8VDJ3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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HdlbpQ8VDJ3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdlbpQ8VDJ3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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HdlbpQ8VDJ3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdlbpQ8VDJ3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdlbpQ8VDJ3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HdlbpQ8VDJ3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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HdlbpQ8VDJ3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HdlbpQ8VDJ3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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HdlbpQ8VDJ3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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HdlbpQ8VDJ3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HdlbpQ8VDJ3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HdlbpQ8VDJ3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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HdlbpQ8VDJ3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdlbpQ8VDJ3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdlbpQ8VDJ3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdlbpQ8VDJ3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdlbpQ8VDJ3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdlbpQ8VDJ3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdlbpQ8VDJ3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdlbpQ8VDJ3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdlbpQ8VDJ3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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