Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc6a20aQ8VDB9 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms