Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk8Q8R3L8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms