Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnaaf4Q8R368 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms