Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms