Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Rnf183Q8QZS5 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Rnf183Q8QZS5 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rnf183Q8QZS5 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rnf183Q8QZS5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rnf183Q8QZS5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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