Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms