Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pnma3Q8JZW8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pnma3Q8JZW8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pnma3Q8JZW8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pnma3Q8JZW8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pnma3Q8JZW8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pnma3Q8JZW8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pnma3Q8JZW8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pnma3Q8JZW8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pnma3Q8JZW8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pnma3Q8JZW8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pnma3Q8JZW8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pnma3Q8JZW8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pnma3Q8JZW8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pnma3Q8JZW8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pnma3Q8JZW8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pnma3Q8JZW8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pnma3Q8JZW8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pnma3Q8JZW8 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pnma3Q8JZW8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pnma3Q8JZW8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pnma3Q8JZW8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pnma3Q8JZW8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pnma3Q8JZW8 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pnma3Q8JZW8 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pnma3Q8JZW8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pnma3Q8JZW8 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pnma3Q8JZW8 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pnma3Q8JZW8 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pnma3Q8JZW8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma3Q8JZW8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms