Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trip10Q8CJ53 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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