Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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