Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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