Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slfn5Q8CBA2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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