Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc159Q8C963 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms