Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp20Q8C6M1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp20Q8C6M1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp20Q8C6M1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp20Q8C6M1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp20Q8C6M1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp20Q8C6M1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp20Q8C6M1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp20Q8C6M1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp20Q8C6M1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms