Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

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Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccdc187Q8C5V8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccdc187Q8C5V8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccdc187Q8C5V8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccdc187Q8C5V8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccdc187Q8C5V8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccdc187Q8C5V8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc187Q8C5V8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ccdc187Q8C5V8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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