Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ccdc113Q8C5T8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ccdc113Q8C5T8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ccdc113Q8C5T8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ccdc113Q8C5T8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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