Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms