Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYH8

Chd9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 2,885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd9Q8BYH8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Chd9Q8BYH8 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Chd9Q8BYH8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Chd9Q8BYH8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chd9Q8BYH8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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