Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms