Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm4aQ8BW72 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms