Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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