Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Smarcal1Q8BJL0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Smarcal1Q8BJL0 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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Smarcal1Q8BJL0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Smarcal1Q8BJL0 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Smarcal1Q8BJL0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Smarcal1Q8BJL0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Smarcal1Q8BJL0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Smarcal1Q8BJL0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Smarcal1Q8BJL0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Smarcal1Q8BJL0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Smarcal1Q8BJL0 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Smarcal1Q8BJL0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Smarcal1Q8BJL0 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smarcal1Q8BJL0 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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