Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH15

Cnot10, CCR4-NOT transcription complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot10Q8BH15 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot10Q8BH15 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms