Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BGC1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BGC1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BGC1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BGC1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BGC1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BGC1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BGC1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BGC1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BGC1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BGC1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BGC1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BGC1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BGC1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q8BGC1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q8BGC1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q8BGC1 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q8BGC1 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q8BGC1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q8BGC1 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q8BGC1 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q8BGC1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Q8BGC1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q8BGC1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8BGC1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8BGC1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8BGC1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8BGC1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8BGC1 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8BGC1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms