Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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