Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3cQ80U95 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3cQ80U95 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3cQ80U95 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms