Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms