Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms