Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sbno2Q7TNB8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sbno2Q7TNB8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sbno2Q7TNB8 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sbno2Q7TNB8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sbno2Q7TNB8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Sbno2Q7TNB8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Sbno2Q7TNB8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Sbno2Q7TNB8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Sbno2Q7TNB8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Sbno2Q7TNB8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Sbno2Q7TNB8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Sbno2Q7TNB8 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Sbno2Q7TNB8 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Sbno2Q7TNB8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Sbno2Q7TNB8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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