Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms