Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms