Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms