Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slf2Q6P9P0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slf2Q6P9P0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slf2Q6P9P0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slf2Q6P9P0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slf2Q6P9P0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slf2Q6P9P0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slf2Q6P9P0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slf2Q6P9P0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms