Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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