Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms