Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms