Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pram1Q6BCL1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms