Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Atg9aQ68FE2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Atg9aQ68FE2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Atg9aQ68FE2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Atg9aQ68FE2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms