Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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