Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms