Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Zfp248Q640N4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Zfp248Q640N4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Zfp248Q640N4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Zfp248Q640N4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Zfp248Q640N4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Zfp248Q640N4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Zfp248Q640N4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Zfp248Q640N4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Zfp248Q640N4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Zfp248Q640N4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Zfp248Q640N4 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Zfp248Q640N4 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Zfp248Q640N4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Zfp248Q640N4 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Zfp248Q640N4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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