Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Ccdc18Q640L5 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Ccdc18Q640L5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Ccdc18Q640L5 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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